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細(xì)胞培養(yǎng)上清
?、賹⒓?xì)胞培養(yǎng)上清液吸入離心管中,在2-8℃下以1000×g離心20分鐘,除去細(xì)胞碎片和雜質(zhì),收集上清液備用,
?、跇颖颈4嬖?20℃或-80℃,避免反復(fù)凍融。
01 uniprot
Q:那什么情況下需要測(cè)細(xì)胞裂解液,什么情況下是檢測(cè)細(xì)胞培養(yǎng)液上清呢?
A:首先從細(xì)胞培養(yǎng)的形態(tài)(貼壁細(xì)胞、懸浮細(xì)胞)所檢測(cè)蛋白分泌表達(dá)位置:
在uniprot蛋白數(shù)據(jù)庫(kù)中Subcellular Location 欄目可查到該蛋白的分泌表達(dá)部位
例1:mouse 白介素6的分泌表達(dá)位置,細(xì)胞質(zhì),質(zhì)膜,胞外表達(dá)。
一般采用0.05mol/LTris-HCl,pH7.4磷酸鹽緩沖液(PBS),客戶可根據(jù)樣本及測(cè)定指標(biāo)的情況自行設(shè)定濃度,目的是保持樣本的等滲環(huán)境。
1、細(xì)胞沉淀的收集:
①懸浮細(xì)胞:對(duì)于懸浮培養(yǎng)的細(xì)胞,直接通過(guò)離心收集細(xì)胞沉淀,將培養(yǎng)液在室溫條件下1000轉(zhuǎn)/分,離心10分鐘,棄上清留細(xì)胞沉淀。
②貼壁細(xì)胞:對(duì)于貼壁培養(yǎng)的細(xì)胞,用胰酶將細(xì)胞消化下來(lái),或用細(xì)胞刮將細(xì)胞刮下來(lái),將培養(yǎng)液在室溫條件下1000轉(zhuǎn)/分,離心10分鐘,棄上清留細(xì)胞沉淀。
我們一般建議客戶,細(xì)胞密度不要小于106個(gè)/ml。
2、細(xì)胞沉淀的洗滌:
在細(xì)胞沉淀中加入0.5-1ml的PBS(等滲),輕輕顛倒混勻,將培養(yǎng)液在室溫條件下1000轉(zhuǎn)/分,離心10分鐘,棄上清留細(xì)胞沉淀。重復(fù)上述操作反復(fù)洗滌1~2次。
手工勻漿,超聲破碎,裂解液裂解,反復(fù)凍融。
①手工勻漿:在細(xì)胞沉淀中加入一定量的PBS(PBS的加入量根據(jù)所測(cè)指標(biāo)的不同而有所改變,一般加入0.5ml,細(xì)胞密度不小于一百萬(wàn)個(gè)/ml),混勻,將細(xì)胞懸浮于PBS中,用移液器將細(xì)胞懸浮液移至玻璃勻漿管中(2ml玻璃勻漿管),將玻璃勻漿管置于冰水混合物中,手動(dòng)勻漿3分鐘,然后取破碎好的細(xì)胞懸浮液進(jìn)行測(cè)定。
②超聲破碎:
在細(xì)胞沉淀中加入一定量的PBS(PBS的加入量根據(jù)所測(cè)指標(biāo)的不同而有所改變,一般加入0.5ml,細(xì)胞密度不小于一百萬(wàn)個(gè)/ml),混勻,將細(xì)胞懸浮于PBS中,在冰水浴條件下進(jìn)行如下操作:
a、用超聲粉碎機(jī)進(jìn)行粉碎,可用Soniprep150型超聲波發(fā)生器以振幅14微米超聲處理30秒使細(xì)胞破碎,也可用國(guó)產(chǎn)超聲波發(fā)生儀,用400安培,5秒/次,間隙10秒反復(fù)3~5次。
b、用超聲細(xì)胞破碎儀,300W功率,每次超聲3~5秒,間隔30秒,重復(fù)4~5次。
③裂解液裂解
常用裂解液有SDS、NP-40、TritonX-100,這三種去垢劑的作用是不同的,或者說(shuō)作用力量強(qiáng)弱不同。
1、SDS屬于離子型去垢劑,效果最強(qiáng),基本可以把細(xì)胞核膜破壞掉,DNA會(huì)釋放出來(lái),裂解液變得很粘稠。
2、NP-40是很溫和的去垢劑,1%濃度的基本可以破壞掉胞膜,而對(duì)核膜破壞的作用弱,結(jié)合特定的buffer可以獲得胞漿蛋白。
3、TritonX-100的能力介于NP40和SDS之間,偏向于NP40,也是常用的細(xì)胞裂解液成分之一,在保護(hù)蛋白活性方面有一定作用(SDS基本會(huì)使蛋白變性失活)。
去垢劑屬性只是一方面,buffer、配比、濃度、提取方法和材料處理也都是關(guān)鍵因素
由于很多裂解液都是蛋白變性劑,對(duì)酶活力的測(cè)定有一定的影響,一般不推薦用裂解液進(jìn)行裂解。
④反復(fù)凍融:
在細(xì)胞沉淀中加入一定量的PBS(PBS的加入量根據(jù)所測(cè)指標(biāo)的不同而有所改變,一般加入0.5ml,細(xì)胞密度不小于一百萬(wàn)個(gè)/ml),混勻,將細(xì)胞懸浮于PBS中,放低溫冰箱中結(jié)冰,溶解,再結(jié)冰,再溶解,反復(fù)3次左右)。由于反復(fù)凍融對(duì)酶活力影響較大,一般使用生化法測(cè)酶活時(shí)不能使用。
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