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      1. 技術(shù)專(zhuān)欄

        RNA樣本準(zhǔn)備指南
        供稿:技術(shù)部發(fā)布時(shí)間:2022-06-06瀏覽量:9249次

        1、樣本RNA得率以及各類(lèi)項(xiàng)目最低起始量

        ?

        各樣本Total RNA得率統(tǒng)計(jì)(僅供參考):

        測(cè)序項(xiàng)目推薦起始量(起始量?jī)H供參考,外泌體不允許18s/28s rRNA有峰):

        表達(dá)譜芯片及小RNA測(cè)序體液樣本及外泌體項(xiàng)目起始量(僅供參考)

        ?

        2、各類(lèi)樣本準(zhǔn)備指南

        2.1 動(dòng)物組織/臨床組織采集

        ① 取新鮮組織,組織體積要小,盡量長(zhǎng)寬高≤0.5cm,考慮到可操作性,所切組織塊的大小可參考綠豆顆粒的大小

        ② 去除非研究的組織類(lèi)型(如結(jié)締組織,脂肪組織等),如果是臨床病變組織的取材要正確判斷病變以及正常組織,應(yīng)將病變組織周?chē)恼=M織去掉,反之亦然。

        ③ 迅速用2-6℃預(yù)冷RNase-Free水配制的1×PBS或生理鹽水清洗組織表面的血跡和污漬,使用無(wú)塵紙巾吸干表面的液體

        ④ 處理好的組織迅速放入預(yù)冷好的已寫(xiě)好編號(hào)的RNase-Free的帶螺紋口的耐-192℃超低溫凍存管中,迅速置于?液氮速凍1小時(shí)后轉(zhuǎn)存于-80℃長(zhǎng)期保存,在RNA提取前避免反復(fù)凍融。

        注意事項(xiàng):

        a. 如果實(shí)驗(yàn)室沒(méi)有條件,如缺乏液氮、干冰以及-80℃冰箱等條件下,需要RNAlater及類(lèi)似組織保存液保存的樣本,嚴(yán)格按照操作說(shuō)明進(jìn)行,迅速的將樣本分割成長(zhǎng)寬高≤0.5cm,約豌豆大小的小塊(一般重約100mg,不過(guò)無(wú)需精準(zhǔn)測(cè)量,一般需要10個(gè)小塊左右),由于組織塊過(guò)大會(huì)影響RNAlater滲透入組織內(nèi)部的效率,組織塊過(guò)大也會(huì)造成RNAlater無(wú)法完全覆蓋組織,而未被RNAlater覆蓋的組織部位極易被核酸酶降解。然后投入提前準(zhǔn)備好的裝滿RNAlater的1.5mL的EP管中,使樣本完全浸沒(méi)在液體中,然后置于4℃中保存過(guò)夜,干冰運(yùn)輸,或-80℃保存。

        b. 不允許寄送用裂解液保存的組織樣本,因?yàn)閷?shí)驗(yàn)中發(fā)現(xiàn)用Trizol保存的組織樣本,無(wú)論是研磨好的粉末還是切割好的組織塊,所抽RNA質(zhì)量普遍很差;

        c. 動(dòng)物及臨床組織不要使用錫箔紙包裹,錫箔紙容易與動(dòng)物及臨床組織粘一起,RNA抽的過(guò)程錫箔紙容易帶入,引起污染。

        2.2 細(xì)胞樣品的采集

        貼壁細(xì)胞的處理:

        ① 從培養(yǎng)箱取出貼壁生長(zhǎng)細(xì)胞,顯微鏡下觀察細(xì)胞確定生長(zhǎng)狀態(tài)良好培養(yǎng)基

        ② 小心加入與培養(yǎng)基等體積的無(wú)酶水配制的1×PBS后,平放1min洗滌細(xì)胞,然后棄去PBS,重復(fù)一次

        ③ 加入適量裂解液反復(fù)吹打至充分裂解(以TriZol為例,10-15cm的大皿,每次先添加1-2mL,吹打混勻,裂解充分的標(biāo)準(zhǔn)為吹打時(shí)液體不粘稠,流動(dòng)性好。如果液體過(guò)于粘稠說(shuō)明還未裂解充分,需添加裂解液,每次添加的量建議為100μL左右持續(xù)添加,直到液體不粘稠為止)

        ④轉(zhuǎn)移至?耐-192℃低溫的螺紋口凍存管后,-80℃冰箱長(zhǎng)期保存,干冰運(yùn)輸

        懸浮細(xì)胞的處理:

        ①選取生長(zhǎng)狀態(tài)良好的細(xì)胞懸液

        ②200-1000g離心5-10min,得到細(xì)胞沉淀培養(yǎng)基

        ③加入適量 RNase-Free水配制的1×PBS后,寬口槍頭輕柔吹打重懸細(xì)胞沉淀,然后用200g離心5min,棄PBS, 重復(fù)一次

        ④加入適量TriZol裂解液反復(fù)吹打至充分裂解(裂解標(biāo)準(zhǔn)同上面的貼壁細(xì)胞處理方式類(lèi)似)

        ④轉(zhuǎn)移至?耐-192℃低溫的螺紋口凍存管后,-80℃長(zhǎng)期保存,干冰運(yùn)輸

        注意事項(xiàng):

        a. 勿將干凍的細(xì)胞直接寄送,因?yàn)榧?xì)胞冷凍的過(guò)程中冰晶很容易刺破細(xì)胞,此時(shí)破碎的細(xì)胞會(huì)容易對(duì)RNA和RNA降解

        b. 細(xì)胞樣品勿用胰酶消化,胰酶會(huì)消化細(xì)胞膜上的膜蛋白,導(dǎo)致細(xì)胞破裂,破裂的細(xì)胞會(huì)釋放核酸酶。

        2.3 植物組織組織采集

        ①選取新鮮、幼嫩、生長(zhǎng)旺盛的組織部位,植物組織越幼嫩越新鮮所含的次生代謝產(chǎn)物越少,隨著植物的逐漸成熟,所含的次生代謝產(chǎn)物產(chǎn)量越來(lái)越多,而次生代謝產(chǎn)物會(huì)影響RNA的抽。以草莓的花為例,這么個(gè)體量的花,4朵即可,其它花朵樣本一類(lèi)推。

        ②(部分樣本可選項(xiàng))迅速用預(yù)冷的RNase-Free水配制的1×PBS或生理鹽水清洗組織表面的污漬,吸干表面的液體。用剪刀剪切成合適的大?。ㄈ舴翘厥馇闆r,長(zhǎng)度最好不要超過(guò)2cm)

        ③處理好的組織迅速放入預(yù)冷好的已寫(xiě)好編號(hào)的RNase-Free的?耐-192℃低溫的螺紋凍存管中,或用標(biāo)記好名稱(chēng)的錫箔紙包裹好,?液氮速凍>1小時(shí),轉(zhuǎn)移到-80℃長(zhǎng)期保存,在RNA提取前避免反復(fù)凍融,干冰寄送樣本。若在離體后10min未用液氮速凍降溫,極有可能引起樣本降解。不可直接將樣本放入-80℃保存,此時(shí)低活性的RNase仍能引起樣本降解

        注意事項(xiàng):

        a. 植物組織不建議RNAlater保存,因?yàn)橹参锝M織含有細(xì)胞壁及次生壁,RNAlater不易滲透入組織內(nèi)部;特別是表面有蠟質(zhì)的植物種植,勿用TriZol直接浸泡植物組織

        b. 不允許將植物組織磨成粉寄送。

        c. 表面含有較多蠟質(zhì)的植物樣本或次生代謝產(chǎn)物含量極高的植物組織或植物組織的莖和根及種子RNA得率通常會(huì)較低,為提高RNA的得率需要加大送樣量,為普通樣本送樣量的3-4倍。

        2.4 全血/PBMC/血清/血漿以及其他體液樣本搜集

        聯(lián)川生物推薦使用BD公司的PAXgene?采血管采集全血,使用BD公司的真空采血管采集全血后分離血清,或使用EDTA紫色抗凝管搜集全血樣本以及分離后續(xù)的血漿樣本。不允許使用綠色的肝素采血管采集全血,因?yàn)楦嗡貢?huì)影響PCR酶的逆轉(zhuǎn)錄效率。

        a. PAXgene采血管采集全血方式:

        ①采血前,應(yīng)將采血管恢復(fù)室溫,推薦溫度為18-25℃(一般PAXgene采血管保存于室溫或4℃,最高不超過(guò)40℃)

        ②采血時(shí),假如前面已經(jīng)使用了多種采血管采集血液時(shí),應(yīng)該在最后使用PAXgene采血管;PAXgene采血管時(shí),先用另一個(gè)采血管采集1-2mL血樣,丟棄該采血管,再使用PAXgene采血管。這種作用是因?yàn)椋裳魅莘e能被預(yù)灌注,另減少血壓造成的沖擊力,一定程度上清洗采血管,采血量:2.5ml,適用對(duì)象:人和靈長(zhǎng)類(lèi)動(dòng)物。

        ③采血后,立即上下顛倒勻十次左右,18-25℃正立放置2h。④ 若不立即提取,將采血管正立置于塑料試管架上(注意:試管架與采血管之間需留有空隙,防止低溫保存過(guò)程中管壁開(kāi)裂),先于-20℃放置24h,然后轉(zhuǎn)移至-80℃進(jìn)行長(zhǎng)期保存或轉(zhuǎn)移至干冰中進(jìn)行運(yùn)輸。注意,在這一步中需要把采血管中的全血樣本轉(zhuǎn)到螺紋口凍存管即可放入-80℃冰箱,無(wú)需再將凍存管在?液氮速凍1小時(shí)。

        ⑤運(yùn)輸時(shí)請(qǐng)使用厚壁泡沫盒,放入充足的干冰,在樣品保存及運(yùn)輸過(guò)程中應(yīng)避免反復(fù)凍融。

        b. EDTA采血管/真空采血管采集全血方式:

        ①樣本采集前,先用75%的酒精棉由內(nèi)向四周對(duì)采血部位進(jìn)行消毒

        ②采血至特定的采血管中,數(shù)量達(dá)到負(fù)壓允許的最大值

        ③樣本采集完成后,立即輕柔顛倒混勻10次。動(dòng)作盡可能平緩。加入三倍以上體積的TriZol(TriZol:血液≥3:1)裂解液混勻,此時(shí)出現(xiàn)沉淀為正常情況。

        ④混完畢后,立刻轉(zhuǎn)入?耐-192℃低溫的螺紋口凍存管,轉(zhuǎn)入-80℃冰箱保存,干冰運(yùn)輸。注意采血至提取RNA最長(zhǎng)時(shí)間不得超過(guò)一周。

        c. 血漿中PBMC提取法:

        ①接著上一步EDTA抗凝管離心后分那一步,將Ficoll和PBS從低溫恢復(fù)到室溫

        ②向50mL離心管(標(biāo)記A)中加入10mL Ficoll,隨后最好靜置一段時(shí)間;向另一50mL離心管(標(biāo)記B)加入10mL PBS

        ③稀釋?zhuān)簻睾蛽u勻抗凝采血管,用 kimwipes或者消毒紗布移除上蓋并放一邊,將 10mL血液轉(zhuǎn)移至B離心管,溫和混合,獲得PBS混合液(20mL)

        ④適度傾斜離心管A,將20mL PBS 混合液沿壁緩慢加入(注意要緩慢,過(guò)快會(huì)穿破Ficoll層,極大影響提取效果)

        ⑤梯度離心:小心地將離心管放入離心機(jī)(不要擾動(dòng)液體層),室溫400g 20min離心,加速/減速分別設(shè)置為1/0

        ⑥離心之后小心將其取出,放置于操作臺(tái)上,可見(jiàn)分為四層,見(jiàn)上圖

        ⑦可選:先移除淋巴細(xì)胞層上2-3mm的血漿,方便后面吸取

        ⑧用P1000移液槍盡可能吸取PBMC,轉(zhuǎn)移至15mL離心管,盡量避免吸取血漿和Ficoll

        ⑨加入PBS 使體積變?yōu)?0mL,蓋上蓋并溫和翻轉(zhuǎn)搖勻5次

        ⑩室溫 300g 10min離心,加速/減速分別設(shè)置為9/9。去上并輕彈離心管末端,直至細(xì)胞團(tuán)在剩余PBS中完全重懸

        注意事項(xiàng):重復(fù)步驟⑨-⑩,最后按照TriZol和體積約3:1的比例加入TriZol保證充分裂解,裂解標(biāo)準(zhǔn)請(qǐng)參考上面貼壁細(xì)胞裂解液處理方式

        d. 血清樣本(外泌體適用)

        ①建議使用進(jìn)口醫(yī)用血清管或真空采血管等收集全血

        ②上下輕輕顛倒混勻十次后,立即將全血置于4°C或冰盒中正立放置

        ③1800g 10min離心分離得到上層血清樣本(全血需在1h內(nèi)進(jìn)行血清分離,依據(jù)血清管操作說(shuō)明或客戶實(shí)驗(yàn)室血清分離步驟進(jìn)行操作)

        ④將血清轉(zhuǎn)移至1.5mL離心管中,13000g離心2min;

        ⑤將上清轉(zhuǎn)移至規(guī)格在200μL-1.5mL耐-192℃超低溫螺紋口凍存管中,每份樣本至少≥100μL(0.1mL)。?液氮速凍1h后-80℃保存,干冰運(yùn)輸

        e. 血漿樣本(外泌體適用)

        ①建議使用紫色EDTA抗凝管收集全血樣本

        ②上下輕輕顛倒混勻十次后,立即將全血置于4°C或冰盒中正立放置

        ③1200g 10min離心分離得到上層血漿樣本(全血需在1h內(nèi)進(jìn)行血漿分離,依據(jù)抗凝管操作說(shuō)明或客戶實(shí)驗(yàn)室血漿分離步驟進(jìn)行操作)

        ④將血漿轉(zhuǎn)移至1.5mL離心管中,13000 g離心2min

        ⑤將上清轉(zhuǎn)移至規(guī)格在200μL-1.5mL耐-192℃超低溫螺紋口凍存管中,每份樣本至少≥100μL(0.1mL)。?液氮速凍1h后-80℃保存,干冰運(yùn)輸

        注意事項(xiàng):

        a.分離血清血漿應(yīng)嚴(yán)格按照操作說(shuō)明進(jìn)行,操作需在1h內(nèi)完成,避免出現(xiàn)溶血現(xiàn)象,血清血漿分離后避免反復(fù)凍融。

        b. 血清血漿送樣量的原則:越多越好,如果客戶手頭上的血清血漿量較少,則有多少就送多少,通常該種類(lèi)型的樣本RNA含量較低,所以需要通過(guò)加大樣本量以富集足夠多的RNA,以保證后續(xù)實(shí)驗(yàn)的順利進(jìn)行,此外血清血漿RNA通常不質(zhì)檢

        c.分離血清/血漿樣本的全血不可冷凍,混入的血細(xì)胞的樣本盡量棄盡,已無(wú)法使用

        d血清/血漿的RNA得率為2-8ng/mL

        小貼士——

        溶血現(xiàn)象解釋?zhuān)杭匆蚣t細(xì)胞細(xì)胞膜的破裂而導(dǎo)致的紅細(xì)胞破碎、血紅蛋白溢出的現(xiàn)象。溶血可由多種物理或化學(xué)因素引起,尤其在人體外,滲透壓的變化、機(jī)械外力,溫度的變化,酸堿度的變化或血液處理的過(guò)程中人為添加的一些化學(xué)物質(zhì),均有可能引起不同程度的溶血

        溶血應(yīng)對(duì)策略:(1)血液離開(kāi)人體后,血液環(huán)境的穩(wěn)定性與保存時(shí)間的長(zhǎng)短呈反比,細(xì)胞膜的穩(wěn)定性也在下降,在這種情況下,應(yīng)盡快開(kāi)展血清血漿的分離;(2)不同的抗凝劑有其不同的分子構(gòu)型,會(huì)對(duì)血液中各細(xì)胞的細(xì)胞膜產(chǎn)生不同的作用,有的會(huì)增加細(xì)胞膜的穩(wěn)定性,有的會(huì)降低細(xì)胞膜的穩(wěn)定性,所以選擇一款合適的抗凝劑至關(guān)重要(抗凝劑推薦:EDTA、檸檬酸鈉);(3)血液存放過(guò)程中溫度過(guò)高或反復(fù)凍融對(duì)細(xì)胞膜有很大的損害。溫度過(guò)高及反復(fù)凍融會(huì)使細(xì)胞膜上的結(jié)構(gòu)蛋白構(gòu)象發(fā)生改變,進(jìn)而造成細(xì)胞膜的彈性降低以致破解產(chǎn)生溶血現(xiàn)象,所以用于分離血清血漿的血液應(yīng)避免反復(fù)凍融

        f. 細(xì)胞上清液、尿液、唾液、羊水、腦脊液(外泌體相似)

        ①收集細(xì)胞上清液、新鮮尿液、唾液、羊水、腦脊液(起始量按照前面表格中提示),要確保不能溶血(血液中蛋白會(huì)污染樣品蛋白);置于4°C 或冰盒中正立放置,轉(zhuǎn)移至RNase-free離心管。以下操作請(qǐng)?jiān)跇颖臼占蟮?h內(nèi)進(jìn)行,以防RNA降解

        ②在4°C條件下離心3000g約10 min,去除細(xì)胞及碎片

        ③將上清小心傾倒入新的RNase-free離心管(注意不要轉(zhuǎn)移沉淀),在4°C條件下離心13000g約2 min,去除殘留的碎片及細(xì)胞

        ④轉(zhuǎn)移上清至全新的耐-192℃超低溫螺紋口凍存管中,?液氮速凍1h(可選),嚴(yán)密封口。-80°C保存,干冰運(yùn)輸

        注意事項(xiàng):細(xì)胞上清液碎片過(guò)多,需要充分低速離心多次去除碎片。收集尿液的前一天飲食要清淡,晨起中尿(臨床),晨間1h的尿液(動(dòng)物)。唾液搜集之前需要禁食禁煙禁酒2h以上,上午9:30-11:30取樣,蒸餾水漱口,將唾液吐于無(wú)菌的痰杯(保持水浴),不要咳痰,采集唾液時(shí)間為30min左右,4℃ 10000rpm 10min,取上清,經(jīng)0.22μm濾膜過(guò)濾除菌。

        2.5 石蠟組織

        手術(shù)/活檢組織石蠟塊

        RNA單次提取需35mg以上的量。從醫(yī)院病理科切取手術(shù)組織總量≥35mg(綠豆大小,不可取暴露于空氣中的組織截面部分),活檢組織長(zhǎng)度>1cm,需2-3條,蠟塊完整,無(wú)磕碰損傷的石蠟包埋組織。未切片的石蠟塊4℃或常溫運(yùn)輸即可

        手術(shù)/活檢組織石蠟卷片/活檢組織石蠟切片

        RNA提取一次提取<80μm。從醫(yī)院病理科切取組織厚度約為10-20μm的石蠟卷片,手術(shù)組織10張(組織>1×1cm2),或20張(組織<1×1cm2),穿刺組織20-25張。將切好的卷片放置于耐-192℃超低溫螺紋口凍存管,迅速浸入液氮速凍>1h, -80℃保存或者干冰運(yùn)輸。

        注意事項(xiàng):

        a. 送樣優(yōu)先順序:?石蠟塊>石蠟卷>石蠟切片

        b. 所有石蠟組織樣本需盡量送檢一年以內(nèi)的樣本,?不得超過(guò)18個(gè)月,建議提供一張免疫組化或組化染色切片

        c. 新制切片常溫放置應(yīng)在1周以內(nèi),2-8℃放置應(yīng)在1個(gè)月以內(nèi),-20℃貯存應(yīng)在6個(gè)月以內(nèi)

        d. 強(qiáng)烈建議每個(gè)貼片盒中只存放一個(gè)患者的樣本;若需與其他患者樣本放在一起,必須做間隔區(qū)分,防止樣本接觸造成污染

        e. 強(qiáng)烈不建議使用添加瓦楞紙或自折Z形紙擺放石蠟切片,因運(yùn)輸過(guò)程中的碰撞會(huì)導(dǎo)致石蠟切片擠到一起,造成切片破損或樣本污染。

        石蠟組織容器

        石蠟切片示例

        2.6?非致病性細(xì)菌樣本采集

        一次反應(yīng)所需細(xì)菌的量≤1×107個(gè)

        ①顯微鏡下觀察生長(zhǎng)狀態(tài),收集對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期細(xì)菌;

        ②將適量體積的菌液轉(zhuǎn)移至2mL旋蓋尖底R(shí)Nase-Free離心管中,室溫或4℃下14000g離心4-10min

        ③棄盡培養(yǎng)基,將細(xì)菌沉淀迅速置于?液氮速凍>1h,然后轉(zhuǎn)移至-80℃或液氮中長(zhǎng)期保存,干冰運(yùn)輸

        2.7?非致病性真菌樣本采集

        一次反應(yīng)所需真菌的量≤50mg,將真菌稱(chēng)重,分裝多管;將稱(chēng)重后的真菌置于預(yù)冷的耐-192℃超低溫螺紋凍存管中,迅速投入液氮,速凍時(shí)間>1h,轉(zhuǎn)入-80°C長(zhǎng)期保存或用干冰直接寄出。

        2.8 致病性真菌細(xì)菌處理方法

        所有可能致病的真菌、細(xì)菌RNA項(xiàng)目樣品,均需要按下面步驟預(yù)處理以后才能寄送至公司,且需要提前通知實(shí)驗(yàn)室,明確菌種。溶液A,B可以向?qū)嶒?yàn)室索要。實(shí)驗(yàn)室將對(duì)未經(jīng)處理的可能致病的樣品,進(jìn)行銷(xiāo)毀處理

        ①細(xì)菌/真菌沉淀(不超過(guò)30mg,約綠豆大?。┘尤?00ul溶液A,吹打重懸菌體。

        ②在重懸的菌體中加入400ul溶液B,劇烈震蕩混勻。

        ③65℃水浴或金屬浴加熱30min,每隔5min劇烈震蕩一次,防止分層。

        ④處理結(jié)束以后,-80℃凍存,干冰運(yùn)輸。如為致病菌,請(qǐng)用70%乙醇處理容器表面(注意如處理過(guò)程中編號(hào)模糊,處理后重新寫(xiě)好編號(hào)),確保安全。

        注意事項(xiàng):

        1)室溫較低時(shí)溶液A可能析出沉淀,可65℃預(yù)熱2-3min待沉淀溶解后混勻使用。

        2) 溶液B有腐蝕性,使用注意安全操作。溶液B為有機(jī)溶液,上層液體為水,吸取時(shí)確保將槍頭插入下層液體。

        3) 溶液A,B不互溶,操作時(shí)需要震蕩充分,使兩種液體形成乳濁液。

        4) 樣品提交單上請(qǐng)注明:樣品經(jīng)過(guò)溶液A,溶液B預(yù)處理。

        2.9?Total RNA樣品

        Total RNA一般長(zhǎng)期保存于-80℃冰箱,若要寄送可直接使用干冰寄出,或加入適量保存液,再用干冰運(yùn)輸。

        RNA的保存介質(zhì)(建議濃度>50ng/μL):

        ①RNA保存液(1/10體積3M NaAc,pH=5.2,3倍體積無(wú)水乙醇)

        ②3倍體積無(wú)水乙醇

        ③RNase-free水(送樣量>15μL)

        注意事項(xiàng):

        (1) total RNA中應(yīng)盡量避免多糖、蛋白、DNA等雜質(zhì)的殘留,送樣時(shí)需注明溶劑成分

        (2) total RNA應(yīng)避免反復(fù)凍融,由于反復(fù)凍融所產(chǎn)生的剪切力會(huì)對(duì)RNA樣品有破壞作用,所以在實(shí)際操作中,應(yīng)對(duì)RNA樣品小量分裝

        輔助材料

        1. 樣本包裝注意事項(xiàng)

        ①在包裹樣本的鋁箔或冷凍保存管表面,用油性記號(hào)筆標(biāo)明樣本編號(hào)及樣本類(lèi)型。并且不要與乙醇等有機(jī)溶劑接觸

        ②不要用紗布、紙張直接包裹樣本,而是用鋁箔或冷凍保存管包裹后再裝入樣本袋中

        ③不要用玻璃容器在液氮中保存樣本;

        ④不要把標(biāo)簽紙或其他紙制的說(shuō)明性文件放入樣本袋內(nèi),因?yàn)榧垙堅(jiān)谝旱惺且姿榈?/font>

        ⑤標(biāo)簽紙應(yīng)該貼于樣本袋繩上,不要貼于容器表面以免脫落造成樣本混亂

        ⑥ 不要在一樣本袋中放過(guò)多的樣本,以防無(wú)法放入液氮罐或無(wú)法從液氮罐中取出。樣本袋在使用前先在液中預(yù)冷

        ⑦ 客戶在填寫(xiě)《樣本登記單》時(shí)應(yīng)當(dāng)詳細(xì)描述(臨床樣本則最好也注明臨床病因及所處階段)樣本的類(lèi)型、處理方法、儲(chǔ)存條件以及儲(chǔ)存時(shí)間等相關(guān)細(xì)節(jié),以便技術(shù)人員確定合理的實(shí)驗(yàn)方案

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        樣本儲(chǔ)存注意事項(xiàng)

        ① 液氮速凍完畢后,攜帶樣本的凍存管或錫箔紙等應(yīng)該立即放入-80℃保存。常規(guī)樣本在10min內(nèi)必須立刻使用液氮速凍,不可直接將樣本在未經(jīng)液氮速凍處理后直接放入-80℃保存。未經(jīng)液氮淬滅的樣本中還會(huì)殘留低活性的酶,從而引起核酸降解以及蛋白變性

        ② 組織樣本采集后,樣本迅速放入進(jìn)口高質(zhì)量?jī)龃婀苤?,凍存管推薦使用進(jìn)口的并且耐低溫-192℃的螺紋口凍存管,擰緊后立即放入液氮。然后再轉(zhuǎn)移到-80℃中保存。如果因?yàn)闆](méi)有擰緊會(huì)導(dǎo)致液氮流入凍存管,空氣熱脹冷縮后發(fā)生爆炸

        ③ 組織樣本儲(chǔ)存于液氮或-80℃冰箱中。對(duì)于液氮保存樣本,務(wù)必注意,不要用非螺口離心管和國(guó)產(chǎn)凍存管,因?yàn)檫@些管子從液氮中取出時(shí)極易發(fā)生管子爆裂而造成樣本損失。建議使用第②條提到的凍存管。實(shí)在條件缺乏必須使用封口膜將離心管充分封鎖防止爆炸(不推薦這樣操作)

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        樣本運(yùn)輸注意事項(xiàng)

        ① 飛機(jī)運(yùn)輸干冰上限約為20公斤,超過(guò)20公斤原則上不能運(yùn)輸?;疖?chē)運(yùn)輸不受限制。

        ② 干冰運(yùn)輸應(yīng)采用壁厚且質(zhì)量完好的泡沫箱,材料用編號(hào)后的凍存管存放,用塑料袋包裝后埋入干冰中,泡沫箱應(yīng)扣嚴(yán)并用封箱帶封嚴(yán)。外套紙殼箱包裝,以免碰裂。并標(biāo)明輕取輕放提示,以保證安全運(yùn)輸

        ③ 干冰運(yùn)輸可委托當(dāng)?shù)乜爝f公司,盡量確保48小時(shí)內(nèi)送達(dá)公司,不能送貨上門(mén)的應(yīng)提前通知公司相應(yīng)人員。

        ④ 24小時(shí)到達(dá)的,干冰總量不得低于5公斤;48小時(shí)到達(dá)的,干冰總量不得低于8公斤。夏季可以適當(dāng)再多增加部分干冰(平時(shí)的1.5倍)。不要使用大塊狀干冰或完全呈粉末狀的干冰,而是需要小的圓柱體干冰,否則運(yùn)輸過(guò)程中自重比較大的塊狀干冰可能會(huì)在箱內(nèi)擠壓樣品盒,移動(dòng)中可能造成樣品盒破裂。如果只有大塊狀干冰可以使用,那么裝箱時(shí)先砸碎成小塊

        ⑤ 包裝時(shí)建議用大塑料袋包裹干冰并在箱中放冰袋,可有效減緩干冰揮發(fā)速度。選擇合適大小,且箱壁較厚的泡沫箱,并在泡沫箱外縱橫方向都纏上透明膠,最好是將泡沫箱外壁用膠帶覆蓋一遍,防止運(yùn)輸途中因擠壓和拋擲而破裂。泡沫箱全部纏上膠帶后,為防止密封過(guò)緊,氣密性過(guò)強(qiáng),干冰揮發(fā)產(chǎn)生過(guò)大壓力而造成泡沫箱爆裂,用美工刀或其他薄刃刀具,將纏在泡沫盒蓋和箱體接合處的膠帶刺破一個(gè)1-2厘米的小縫隙,以在氣壓過(guò)高時(shí)排出氣體

        ⑥ 如委托快遞運(yùn)輸,運(yùn)輸過(guò)程中應(yīng)隨時(shí)跟蹤貨物的情況,記錄貨單號(hào),并保持與發(fā)出地和接收地的快遞公司的聯(lián)系

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        注意事項(xiàng)

        ① 客戶如果提供凍存可復(fù)蘇的細(xì)胞株,應(yīng)首先驗(yàn)證所用凍存方法用于RNA提取的可靠性,并且在送樣時(shí)提供詳盡的復(fù)蘇方法,以便確保實(shí)驗(yàn)成功

        ② 所有樣本均應(yīng)標(biāo)明準(zhǔn)確的樣本編號(hào),同時(shí)配有一張樣本登記表,寫(xiě)明樣本名稱(chēng)、物種、編號(hào)、取樣日期、樣本處理情況等。

        ③ 提取RNA質(zhì)與量:a. 處于不同發(fā)育階段以及不同生長(zhǎng)條件的樣本中所含有的RNA、RNA以及蛋白的量是不同的,在某些實(shí)驗(yàn)條件下或某些病變部位獲得的樣本中核酸的量可能與常規(guī)相應(yīng)樣本有顯著的差異;b. 儲(chǔ)存條件以及儲(chǔ)存時(shí)間也是影響RNA質(zhì)與量的關(guān)鍵因素。一般來(lái)說(shuō)從新鮮的樣本中總是能夠得到預(yù)期的核酸量,并且含量相對(duì)較高,更容易檢測(cè)。但是沒(méi)有保存在液氮或-80℃冰箱中的樣本是不可靠的,因此,強(qiáng)烈建議盡可能低溫保存。

        ④ 關(guān)于備份,為確保實(shí)驗(yàn)的順利,我們強(qiáng)烈建議您在取樣時(shí),應(yīng)同時(shí)備份2-3份,如備份3份,則送給我們兩份,如果備份 2份,則送樣一份,您自己留一份,以防備部分樣本降解,重新取材或送樣耽誤您的時(shí)間。即使樣本全部合格,備份的樣本您還可以用來(lái)進(jìn)行其他方面的實(shí)驗(yàn)(如定量驗(yàn)證,蛋白方面,生化方面的實(shí)驗(yàn)等)。備份又分為兩種,一種為嚴(yán)格備份,即樣本取下后一分為二,這樣的兩份樣本基本上具備同性質(zhì)。另一種為非嚴(yán)格備份,即生物學(xué)重復(fù)的樣本,這樣的備份樣本同質(zhì)性要較前者差。

        6

        樣本寄送指南

        ① 將收集好的樣本置于相應(yīng)的收集管中,為防止樣本混淆管蓋和管壁均要書(shū)寫(xiě)編號(hào),并用封口膜封口;

        ② 將樣本放入自封袋中,在樣本提交單上填好樣本詳細(xì)信息(編號(hào)等信息必須嚴(yán)格與樣本管上一致),將填好的樣本單和樣本一起放入泡沫箱中;

        ③ 選用大小合適、箱壁大于4 cm且密封性良好的泡沫箱,并在泡沫箱外縱橫方向都纏上透明膠,防止泡沫箱在運(yùn)輸過(guò)程中的開(kāi)裂。

        ④ 樣本寄送步驟:

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